2016年，面对历史罕见的巢湖流域大洪水，在巢湖水位比1991年仅差3厘米的情况下，全市淹没面积66平方公里，仅为1991年555平方公里的12%，淹没损失减少90%，防洪减灾效益十分明显。之所以能取得这样的成绩，与近年新建的防洪治河工程密切相关。事实上，巢湖综合治理不仅大大提升巢湖流域防洪标准，而且有效改善了巢湖水质。
入湖河道整治出“清泉”
南淝河下游河道整治工程二期到明年汛期前将全部完成；十五里河干支流小流域治理河口闸站枢纽工程计划5月底前完成设备安装调试，明年将初步发挥工程的基本功能……近年来，为综合治理巢湖，进一步提高巢湖防灾减灾能力，改善巢湖水质，保护河湖环境，修复流域生态，支撑可持续发展，合肥全力推进巢湖综合治理与系统保护。2012年合肥通过积极努力争取到国家开发银行支持，全面启动了环巢湖地区水环境治理与生态修复工程建设，其中一期工程于2012年开工建设，二期工程于2013年开工建设，三期、四期工程正在开展前期工作。
目前，在南淝河下游河道综合治理一期工程中，堤防加固、穿堤建筑物拆除重建、堤后填塘和马家渡分洪道开挖工程实施后，不仅提升了防洪标准，也大大减轻南淝河污染。据初步统计，每年可减少人畜污染800吨。这段区域与国家级森林公园相得益彰，也为市民提供了休闲观光好去处。
如今，在二期项目中，南淝河沿线正在建设8座泵站和12座涵闸，旱季时确保有水可灌溉，预计在今年汛期前部分工程完工。合肥市水务局相关负责人介绍说，泵站可以让十八联圩的水及时排到南淝河，再入巢湖，在汛期发挥效益。与此同时，800米护坡及步游道的建设，将显著改善这里的生态环境。
污水收集处理将实现全覆盖
“至2020年左右，西部湖区水质从现状的劣Ⅴ类或Ⅴ类基本达到Ⅳ类，东部湖区水质由现状的Ⅳ类达到Ⅲ类，国控考核断面水质基本达标，湖区蓝藻爆发得到初步抑制。”据介绍，环巢湖地区水环境治理与生态修复工程项目完成后，受污染河段或防洪设施薄弱河流治理实现全覆盖，城区、园区和规模以上乡镇生活及工业污水收集及处理实现全覆盖。
不仅如此，大型水库及重要中型水库水源地保护体系将基本形成，西河应急引江和驷马山江水西调工程完成，年均补给巢湖和南淝河水系的江水分别为5亿立方米和1.2亿立方米左右。南淝河、十五里河、派河等重污染入湖河道水质逐步好转，从现状的劣Ⅴ类达到Ⅴ类及以下。
未来几年，在生态修复工程项目基础上，合肥将完成城区、园区和规模以上乡镇生活及工业污水处理提标改造和扩建；继续完善大型水库及重要中型水库水源地保护体系。尤其值得一提的是，引江济巢工程建成后，年均补给巢湖10亿立方米以上江水，驷马山江水西调工程年均补给南淝河的江水扩大至2.5亿立方米左右。而南淝河、十五里河、派河等重污染入湖河道的水质也将明显改善，水质由Ⅴ类达到Ⅳ类及以下。
