从4月26日开始一直持续到5月8日，新疆大部分地区陆续出现降雨、降温天气，对棉花出苗以及苗期生长造成不良影响，其中北疆雨势相对较小，并且持续时间较短，所以对棉田影响整体有限。相反，南疆受灾比较普遍，多区域棉田雨后进行了补种、重播。
北疆：博州、伊犁州、昌吉州等区域降雨持续时间基本在三天以内，对棉花出苗影响不大，但由于5月气温偏低，目前棉花长势较慢。棉花处于三真叶期，株高在15公分上下。据卓创资讯调研了解，预计在在6月10日左右集中现蕾。目前病虫害轻度，种植户打药控制地盲蝽蟓为主。
南疆：巴州、阿克苏地区、和田局部地区雨势较大，并且持续时间较长。棉花出苗率低，部分棉田进行的补种、重播，目前株高在10公分左右。播种较早并且未受灾区域，目前株高在30公分上下，并且已进入第五真叶期，部分进入现蕾期。总体来说，目前南疆棉花长势差异较大。
据新疆气候中心预测：6月平均气温南疆西部、阿克苏地区、北疆北部略偏低，其余地区略偏高；降水量南疆西部、阿克苏地区、伊犁河谷偏多，北疆北部、北疆沿天山一带略偏多，其余地区降水略偏少。预计6月气象条件对阿克苏地区及南疆西部棉花生长略有影响，各棉区做好棉田头水前化控及头水浇灌工作。此外，各地要密切关注作物病虫害的发生发展，做好病虫害的综合防治工作。
