玉树发生地震后，中国民航各单位在第一时间启动应急预案。民航局局长李家祥要求全行业全力以赴投入抗震救灾工作，保证救灾物资运得上去，重伤病员能转运出来，同时确保飞行安全。在民航局的统一组织指挥下，民航各地区管理局协调保障快速有力；空管局、机场、航空油料等保障单位不舍昼夜、全力以赴，通力配合；航空公司以国家大局、人民利益为重，共有12家航空公司无条件参加了救灾运输。截止到16日22时，民航共调动40架飞机，执行救灾包机 168 架次，运送救灾人员3708人次，运送救灾物资423 吨，运送伤员680人。
——迅速评估玉树机场受损程度，短时间恢复机场运行。
地震发生后，玉树机场和外界联络全部中断。民航空管部门通过短波无线电台与机场取得了联系，得知玉树机场无人员伤亡。与此同时，玉树机场工作人员冒着余震的危险，迅速对机场各项设备设施的保障能力进行了全面检查。检查结果，除有线通信和外部供电中断外，其他设备、设施未明显受损。机场通过备份的柴油机应急发电可以保证工作用电。经过评估，玉树机场可以继续提供使用。民航局迅速向外界公布了机场恢复运行的消息，为救援人员和物资在第一时间抵达灾区提供了畅通的空中通道。
——成立抗震救灾指挥部，举全行业之力，全力以赴抗震救灾。
为确保民航抗震救灾工作有力、有序和高效，民航局在西宁成立了抗震救灾指挥部，设立了飞行保障、机场运行、空管保障、医疗救援、新闻媒体等五个工作组，并在玉树机场成立现场协调指挥中心，协调航空公司、机场、空管、油料等相关单位全力配合当地人民政府及相关部门做好抗震救灾工作。民航局副局长夏兴华率工作组在第一时间赶至玉树，指导抗震救灾工作。
——采取积极有效措施，开辟抗震救灾绿色空中通道。
民航局要求各航空公司迅速调配运力，优先运输救灾人员和物资；空管部门优先放行执行救灾任务的飞机；机场简化手续，为救灾飞行提供一切便利。地震发生当天，民航局将东航和国航正在执行航班任务的3架具有高原飞行性能的客机紧急调至西宁，在地震发生后12小时之内，将700名抗震救灾人员和4吨救灾物资从西宁运抵玉树。与此同时，又紧急调配国航、东航、南航、四川、山东、重庆等航空公司的13架飞机，分别从成都、昆明、广州、济南、重庆等地运送1000余名救援人员和多批紧急救援物资飞赴西宁。截止到16日22时，民航共执行救灾包机168 架次，运送来自广州、重庆、成都、云南、山东、河南、陕西、宁夏等地的救灾人员 3708 人；运送血浆、药品、帐蓬、食品、生命探测仪等灾区急需的救灾物资422吨。4月15日，民航通用航空飞机还执行了灾区航摄、灾情探测等任务。
——调集技术骨干驰援玉树机场，充实加强保障力量，确保机场运行畅通无阻。
玉树机场是2009年8月1日新开通的支线机场，每周只有3班至西宁、西安的定期航班。机场海拔3905米，高度位居国内第二，是典型的高高原机场，仅有4个停机位，不具备夜航飞行标准，地形条件复杂，飞行难度非常大。只有经过改装的、能适应高高原飞行的客机和经过特殊训练的飞行员才可以执行航班任务。因此，民航局要求全国各航空公司具有高原飞行性能的39架飞机和具有高原飞行资格的机组集结待命，做好运输准备。同时就近从各单位紧急抽调了近50名气象、通信、管制、急救等方面的专业技术骨干增援玉树机场，以应对大量的救灾飞行和高强度的工作。还紧急调运储备了80吨航油和20吨发电用柴油。截至16日20时，平时两天一个航班的玉树机场超负荷运转，安全保障各类救灾飞行100架次，成为最快捷的生命通道，为实施有效救援争取了时间，为重伤员的救治争取了时间。
